More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7683 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  89.29 
 
 		 254 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  88.49 
 
 		 254 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  87.7 
 
 		 254 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  87.7 
 
 		 254 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  73.23 
 
 		 255 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  71.84 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  72.83 
 
 		 260 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  70.85 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  67.47 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 257 aa  235  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  45.34 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 257 aa  234  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 257 aa  235  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  48.57 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.5 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  47.58 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  47.58 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  45.75 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.81 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  47.33 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 		 251 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  45.63 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  45.93 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  47.39 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  46.22 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  47.37 
 
 		 859 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  43.21 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  45.53 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  44.76 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  45.38 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44.08 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.67 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  45.27 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  44.49 
 
 		 842 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  43.09 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.85 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.66 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  44.08 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  44.31 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  43.44 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  43.6 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  43.72 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  43.67 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  43.62 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  43.72 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  42.29 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  44.67 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  44.22 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.21 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  42.34 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  42.44 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  45.53 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  41.56 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  42.86 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.73 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  46.12 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  44.03 
 
 		 263 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  43.87 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  42.45 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  45.08 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  41.46 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  43.62 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  44.53 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  41.87 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.98 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  42.51 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  41.7 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  42.8 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  42.11 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.28 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  43.9 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  41.98 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  41.63 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  42.91 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  42.06 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  42.17 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.98 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  42.39 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  41.98 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  42.11 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>