More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0938 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  61.63 
 
 
258 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.73 
 
 
263 aa  308  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  61.73 
 
 
259 aa  307  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  61.22 
 
 
257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 
256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  61.29 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  61.2 
 
 
256 aa  301  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  60.91 
 
 
263 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  60.55 
 
 
268 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  61.29 
 
 
256 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  58.57 
 
 
258 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  60.62 
 
 
278 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  60 
 
 
256 aa  298  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  61.98 
 
 
250 aa  298  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  60.91 
 
 
259 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  60.91 
 
 
259 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  60.49 
 
 
259 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  58.54 
 
 
250 aa  297  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  60.48 
 
 
250 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  60 
 
 
256 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  60.4 
 
 
256 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  60.49 
 
 
259 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.49 
 
 
259 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  60.49 
 
 
259 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  60.49 
 
 
259 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  60.08 
 
 
250 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  60.16 
 
 
257 aa  295  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  60.82 
 
 
251 aa  295  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  61.57 
 
 
256 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  60.73 
 
 
277 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  61.57 
 
 
251 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  60.91 
 
 
262 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  59.6 
 
 
256 aa  291  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  58.33 
 
 
256 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  60.08 
 
 
251 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  60.49 
 
 
262 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  57.03 
 
 
255 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  60.49 
 
 
261 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  60.74 
 
 
251 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  58.57 
 
 
263 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  60.49 
 
 
252 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  58.4 
 
 
261 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  59.75 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  58.02 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  60.58 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  58.85 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  62.3 
 
 
250 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  59.18 
 
 
253 aa  276  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  55.51 
 
 
261 aa  271  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  57.96 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  55.97 
 
 
258 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  55.1 
 
 
260 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 
271 aa  264  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 
257 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  55.51 
 
 
257 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  56.79 
 
 
271 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  53.88 
 
 
260 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  56.73 
 
 
257 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
256 aa  254  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  48.13 
 
 
252 aa  229  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  51.87 
 
 
248 aa  222  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  47.35 
 
 
253 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  46.53 
 
 
253 aa  214  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
266 aa  207  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  44.63 
 
 
842 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.37 
 
 
256 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  43.39 
 
 
249 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.57 
 
 
256 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.57 
 
 
256 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  43.85 
 
 
252 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  43.09 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  43.09 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.95 
 
 
256 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.87 
 
 
254 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  42.32 
 
 
249 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  42.32 
 
 
249 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  40.41 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  41.91 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  42.32 
 
 
253 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  40.65 
 
 
255 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 
251 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  43.21 
 
 
254 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  43.8 
 
 
250 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  40.5 
 
 
250 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  43.44 
 
 
260 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.8 
 
 
250 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  43.8 
 
 
859 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
271 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.21 
 
 
254 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>