More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2559 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 249 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.9 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  45.97 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  45.68 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44 
 
 		 254 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  43.03 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  45.53 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.27 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.39 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  41.8 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  42.86 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  43.44 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  43.44 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.86 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.67 
 
 		 859 aa  204  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  44.49 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  42.68 
 
 		 842 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  44.73 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  40.82 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.39 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  41.98 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.03 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  43.67 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  45.45 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.08 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  45.04 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  43.44 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  42.74 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.32 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  43.37 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  45.2 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  42.74 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  42.8 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  42.97 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  42.97 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  41.32 
 
 		 261 aa  197  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  43.21 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  45.02 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.02 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  42.63 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  45.08 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  40.5 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.04 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  43.21 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  43.21 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.98 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  45.45 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  45.53 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  40.08 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  39.59 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  43.21 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  41.91 
 
 		 272 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.18 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  41.15 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40.5 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  42.39 
 
 		 840 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  45.12 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  39.67 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  39.67 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.21 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  45.92 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  45 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  44.08 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.51 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  41.27 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  44.67 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.22 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  44.62 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  47.11 
 
 		 823 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  44.26 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  40.96 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  39.27 
 
 		 262 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  38.68 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  40.91 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  42.74 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  44.44 
 
 		 251 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  39.26 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  39.67 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  39.92 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  44.26 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>