More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0989 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  72.18 
 
 		 250 aa  361  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  70.78 
 
 		 248 aa  343  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.63 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  53.01 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  54.62 
 
 		 250 aa  251  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  54.84 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  53.82 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  50.8 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  51.19 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  50.81 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  48.57 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  50.8 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  49.8 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  48.36 
 
 		 249 aa  238  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  46.94 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  49.2 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  51.23 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  47.97 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  47.18 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  47.97 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  47.37 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  52.02 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  49.19 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  47.18 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  48.15 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  47.35 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  47.74 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  48.35 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  47.22 
 
 		 249 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  45.53 
 
 		 258 aa  221  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.86 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  48.37 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  45.38 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  44.13 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  47.44 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  45.42 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  44.58 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  47.44 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  45.04 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  44.81 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  44.58 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  46.96 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.08 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  46.37 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  44.94 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  43.32 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  45.17 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  45.9 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  46.5 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  46.5 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  48.77 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  47.26 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  43.6 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  44.4 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  41.7 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  41.37 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.15 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  46.22 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  44.73 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  45.93 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  41.22 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  42.34 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  41.37 
 
 		 625 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  41.06 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  39.92 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  41.77 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  46.18 
 
 		 594 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  42.98 
 
 		 842 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  47.37 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  43.55 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.54 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  44.44 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.09 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  40.91 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  41.77 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  43.95 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  43.55 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  43.55 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  40.33 
 
 		 859 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  39.43 
 
 		 265 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  42.74 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.87 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>