More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1320 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  93.2 
 
 		 250 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  76.83 
 
 		 256 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  65.57 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  65.57 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  65.57 
 
 		 250 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  64.75 
 
 		 249 aa  304  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  65.57 
 
 		 250 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  64.61 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.11 
 
 		 250 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  58.2 
 
 		 266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  63.82 
 
 		 741 aa  285  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  56.73 
 
 		 257 aa  284  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  63.41 
 
 		 758 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  63.41 
 
 		 746 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.41 
 
 		 752 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  56.79 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  63.01 
 
 		 761 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.01 
 
 		 746 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  63.01 
 
 		 749 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.01 
 
 		 755 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  56.5 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  56.2 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  56.2 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  56.5 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  55.69 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  57.89 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  57.2 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  58.02 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  57.2 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  56.2 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  54.51 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  53.5 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  52.26 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  51.65 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  52.48 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  51.65 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  52.48 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  52.28 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  48.98 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  45.87 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  44.9 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  45.15 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  42.68 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  43.37 
 
 		 257 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  44.98 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44.86 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.86 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.18 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.18 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  47.74 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  46.84 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  45.9 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  45.49 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.45 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  45.53 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.27 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  45.15 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.94 
 
 		 859 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  46.09 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.18 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.94 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  43.88 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.45 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  41.91 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  44.03 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  44.17 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  46.34 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  43.67 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  44.18 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0156  ABC transporter related  45.53 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  42.34 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0501  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.67 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  40.66 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.91 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  42.62 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  45.19 
 
 		 840 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  46.75 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  41.91 
 
 		 271 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  44.9 
 
 		 852 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  40.76 
 
 		 840 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  42.57 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  43.9 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0174  ABC transporter related  45.27 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159658  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  44.58 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  43.51 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  41.08 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.72 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  45.73 
 
 		 272 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  44 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  43.04 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>