More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2815 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  93.2 
 
 		 250 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  75.2 
 
 		 256 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  65.16 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  65.16 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  65.16 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  63.11 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  62.96 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  63.52 
 
 		 250 aa  298  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.3 
 
 		 250 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  57.32 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  57.32 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  57.32 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  58.2 
 
 		 266 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  56.73 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  62.2 
 
 		 741 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  56.79 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  61.79 
 
 		 746 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.79 
 
 		 752 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  61.79 
 
 		 758 aa  277  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  57.2 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.38 
 
 		 746 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  61.38 
 
 		 761 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  61.38 
 
 		 749 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.38 
 
 		 755 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  56.2 
 
 		 266 aa  274  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  56.2 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  57.09 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  57.2 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  56.61 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  55.97 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  53.5 
 
 		 264 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  54.51 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  51.65 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  51.65 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  51.65 
 
 		 258 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  52.48 
 
 		 266 aa  248  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  51.44 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  48.98 
 
 		 259 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  51.04 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  45.87 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  44.49 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  47.74 
 
 		 248 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  44.63 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  46.09 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  44.58 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  42.74 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  41.87 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  44.03 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.63 
 
 		 251 aa  198  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  44.3 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.58 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  43.37 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  43.37 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  44.73 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  45.53 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  45.57 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  44.26 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.87 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  44.81 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.27 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  46.8 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  44.9 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  45.96 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.62 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.62 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  40.76 
 
 		 840 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  45.93 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  42.04 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  43.32 
 
 		 859 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  43.27 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  41.49 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  43.37 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  42.91 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  40.66 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  44.08 
 
 		 852 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  40.41 
 
 		 863 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  42.57 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  44.19 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  43.5 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  42.51 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  42.51 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  44.49 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  42.51 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  44.35 
 
 		 840 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  43.32 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  43.43 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  41.63 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  41.35 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  41.06 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  44.21 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>