More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1492 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  97.37 
 
 		 266 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  89.81 
 
 		 266 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  89.84 
 
 		 257 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  89.84 
 
 		 259 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  67.94 
 
 		 269 aa  362  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  70.31 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  67.7 
 
 		 258 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  69.6 
 
 		 266 aa  351  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  66.27 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  68.6 
 
 		 249 aa  347  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  66.8 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  67.06 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  67.06 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  67.33 
 
 		 258 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  69.8 
 
 		 257 aa  345  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  68.6 
 
 		 249 aa  344  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  68.72 
 
 		 253 aa  344  8e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  69.84 
 
 		 275 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  65.84 
 
 		 253 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  65.02 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  61.51 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 250 aa  287  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.2 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  56.57 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  56.15 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  56.2 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  52.07 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  50.83 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  51.22 
 
 		 758 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  51.22 
 
 		 746 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  51.65 
 
 		 250 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  51.65 
 
 		 250 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.22 
 
 		 752 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  50.81 
 
 		 761 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.81 
 
 		 755 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  49.8 
 
 		 741 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.81 
 
 		 746 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  50.81 
 
 		 749 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.41 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  47.44 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  44.18 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  46.06 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.83 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.23 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.46 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.46 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.46 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  41.43 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  40.64 
 
 		 840 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.68 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  41.83 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  46.06 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  41.83 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  46.99 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  41.43 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  42.63 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  41.8 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 		 277 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  42.56 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  40.64 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  42.56 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  41.67 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  42.35 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  40.08 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  41.83 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  44.81 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.15 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40.91 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  41.46 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.39 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  42.86 
 
 		 852 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  42.06 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  42.8 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  43.15 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  40.52 
 
 		 268 aa  194  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  40.5 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  41.06 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  41.43 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  40.24 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  42.32 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  41.74 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  40.66 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  42.32 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>