More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1840 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  85.16 
 
 
258 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  84.25 
 
 
259 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  81.64 
 
 
258 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  79.92 
 
 
260 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  79.92 
 
 
260 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  78.03 
 
 
264 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  79.6 
 
 
269 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  81.53 
 
 
275 aa  397  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  75.5 
 
 
257 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  68.25 
 
 
259 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  67.05 
 
 
266 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  67.46 
 
 
257 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  69.6 
 
 
262 aa  351  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  69.35 
 
 
253 aa  350  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  69.8 
 
 
266 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  60.98 
 
 
249 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  60.98 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  60.57 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  60.98 
 
 
253 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  59.35 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  59.5 
 
 
249 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  57.68 
 
 
250 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 
250 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  50.99 
 
 
256 aa  252  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.48 
 
 
250 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  52.48 
 
 
250 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  49.8 
 
 
758 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  49.8 
 
 
746 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.8 
 
 
752 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  47.56 
 
 
250 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  49.4 
 
 
761 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  49.4 
 
 
749 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.4 
 
 
755 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  50 
 
 
741 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.4 
 
 
746 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  48.35 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  47.15 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  47.15 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.69 
 
 
250 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  47.11 
 
 
249 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  46.69 
 
 
249 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  46.12 
 
 
252 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  44.22 
 
 
256 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.74 
 
 
254 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.34 
 
 
254 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  41.56 
 
 
249 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  42.57 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  41.57 
 
 
258 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  42.63 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  42 
 
 
256 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  42.23 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  42 
 
 
256 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
257 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
257 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  43.03 
 
 
277 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  40.56 
 
 
256 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  40.56 
 
 
256 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  42.15 
 
 
259 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  41.83 
 
 
256 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  42.46 
 
 
268 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
257 aa  191  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  42.57 
 
 
256 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.21 
 
 
252 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  40.16 
 
 
256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  41.67 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.74 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  43.44 
 
 
250 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
271 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.44 
 
 
250 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.73 
 
 
254 aa  188  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  39 
 
 
251 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40.91 
 
 
263 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  40.55 
 
 
264 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  41.15 
 
 
256 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  42.51 
 
 
252 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  42.41 
 
 
261 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  40.94 
 
 
252 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  39.76 
 
 
265 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  39.18 
 
 
257 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  43.5 
 
 
250 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 
256 aa  185  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  41.56 
 
 
263 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  40.08 
 
 
272 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 
256 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  44.09 
 
 
257 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
259 aa  185  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  41.27 
 
 
257 aa  185  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  41.49 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.8 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  40.4 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  40 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>