More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2314 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  511  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  46.12 
 
 
260 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
263 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  45.27 
 
 
260 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  45.61 
 
 
244 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  42.86 
 
 
249 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  43.2 
 
 
249 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  42.45 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.45 
 
 
249 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  41.98 
 
 
255 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  43.8 
 
 
268 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  44.73 
 
 
272 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.21 
 
 
269 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  44.21 
 
 
536 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  44.21 
 
 
269 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  44.03 
 
 
269 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
250 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  43.15 
 
 
252 aa  204  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  41.2 
 
 
250 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
251 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  42.8 
 
 
258 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  39.75 
 
 
254 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 
259 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.17 
 
 
256 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.17 
 
 
256 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  39.75 
 
 
254 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  42.98 
 
 
259 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40.64 
 
 
255 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  42.91 
 
 
256 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.45 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  42.8 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  42.8 
 
 
259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  40.65 
 
 
257 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0585  ABC transporter component  42.86 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  41.74 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
255 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  41.13 
 
 
252 aa  198  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  41.56 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.4 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  40.89 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  41.06 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.3 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  41.06 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  41.56 
 
 
258 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  40.4 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.56 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  40.98 
 
 
252 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  40.74 
 
 
266 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  40.74 
 
 
259 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  40.24 
 
 
262 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.87 
 
 
260 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  39.84 
 
 
266 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  40.73 
 
 
249 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  42.45 
 
 
248 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  41.56 
 
 
246 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  41.98 
 
 
275 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  42.91 
 
 
271 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  41.27 
 
 
259 aa  191  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
271 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  39.52 
 
 
250 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  38.25 
 
 
255 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  40.32 
 
 
256 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  40.32 
 
 
256 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  39.84 
 
 
250 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  42.91 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  39.04 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
271 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  40.32 
 
 
256 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  39.36 
 
 
270 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  41.63 
 
 
252 aa  188  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.04 
 
 
250 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  41.37 
 
 
859 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  39.76 
 
 
254 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.24 
 
 
251 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  40.73 
 
 
256 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  38.8 
 
 
252 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  38.93 
 
 
250 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  39.92 
 
 
256 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  38.25 
 
 
250 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  39.75 
 
 
256 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  42.62 
 
 
852 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
253 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  37.25 
 
 
250 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
254 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  39.92 
 
 
254 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  40.24 
 
 
264 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  40.65 
 
 
260 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  40 
 
 
271 aa  184  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  37.6 
 
 
259 aa  184  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  39.51 
 
 
254 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  39.36 
 
 
256 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40.57 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  38.96 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  39.52 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  40.16 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  39.43 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  39.84 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>