More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1773 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  100 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  73.54 
 
 
260 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  73.54 
 
 
260 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  74.8 
 
 
264 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  75.5 
 
 
266 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  78 
 
 
253 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  71.71 
 
 
258 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  71.26 
 
 
259 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  69.72 
 
 
258 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  72.31 
 
 
269 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  72.24 
 
 
275 aa  351  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  70 
 
 
266 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  70.2 
 
 
266 aa  347  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  68.57 
 
 
257 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  68.16 
 
 
259 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  69.8 
 
 
262 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  64.46 
 
 
249 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  63.64 
 
 
249 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  63.64 
 
 
249 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  62.65 
 
 
253 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  61.89 
 
 
249 aa  292  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  60.98 
 
 
250 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  57.68 
 
 
250 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  56.61 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 
250 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 
250 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.2 
 
 
250 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  56.2 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  50.41 
 
 
250 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  51 
 
 
741 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  51.41 
 
 
758 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.41 
 
 
752 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  51.41 
 
 
746 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  51 
 
 
761 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51 
 
 
746 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51 
 
 
755 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  51 
 
 
749 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  49.17 
 
 
250 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  49.17 
 
 
250 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  49.17 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.76 
 
 
250 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  47.93 
 
 
249 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  47.52 
 
 
249 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  46.15 
 
 
252 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  43.2 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  43.37 
 
 
278 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 
250 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  45.38 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  40.86 
 
 
256 aa  195  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  40.86 
 
 
256 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  41.56 
 
 
249 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  41.83 
 
 
261 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.46 
 
 
254 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  42.21 
 
 
256 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.06 
 
 
254 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0501  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.21 
 
 
264 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942704  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  42.11 
 
 
256 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  45.27 
 
 
250 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  43.9 
 
 
252 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.9 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40.65 
 
 
263 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  40.96 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  41.22 
 
 
259 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.74 
 
 
260 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
256 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  40.25 
 
 
840 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
271 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  42.11 
 
 
256 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  42.29 
 
 
257 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.82 
 
 
263 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  40.16 
 
 
256 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  40.16 
 
 
256 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  43.9 
 
 
250 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
259 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
259 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
259 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
259 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
259 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  40.86 
 
 
256 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
259 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
259 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
259 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  40.5 
 
 
260 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  40.65 
 
 
258 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  41.22 
 
 
251 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  43.5 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  40.89 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  41.8 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.32 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  42.86 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.3 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  39.36 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  40.41 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  40.41 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  41.7 
 
 
256 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  39.18 
 
 
251 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 
250 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  40.73 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>