More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1682 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  88.28 
 
 
264 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  82.75 
 
 
259 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  82.81 
 
 
258 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  81.47 
 
 
269 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  79.92 
 
 
266 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  80.08 
 
 
258 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  84.13 
 
 
275 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  73.54 
 
 
257 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  71.19 
 
 
253 aa  361  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  67.97 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  67.97 
 
 
259 aa  355  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  67.05 
 
 
266 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  67.32 
 
 
266 aa  347  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  67.06 
 
 
262 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  62.81 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  61.98 
 
 
249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  61.98 
 
 
249 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  61.98 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  62.4 
 
 
249 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  61.98 
 
 
250 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  57.55 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
250 aa  275  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
250 aa  275  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  51.65 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.65 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  51.65 
 
 
250 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  49.59 
 
 
250 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  48.35 
 
 
250 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  47.93 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  47.93 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  47.58 
 
 
758 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.11 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  47.13 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  47.58 
 
 
746 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.58 
 
 
752 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  47.18 
 
 
761 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.18 
 
 
746 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  47.18 
 
 
749 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.18 
 
 
755 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  46.69 
 
 
249 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  45.93 
 
 
741 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  49.39 
 
 
252 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  44.84 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  45.24 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  45.24 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  44.23 
 
 
258 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  44.05 
 
 
256 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 
257 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.28 
 
 
254 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  42.98 
 
 
259 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.46 
 
 
254 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  42.98 
 
 
263 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  43.25 
 
 
256 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  41.63 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.56 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  43.48 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  43.65 
 
 
256 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  42.13 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  43.39 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  43.39 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  42.13 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  41.06 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.56 
 
 
259 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  42.06 
 
 
256 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  42.56 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  42.56 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  42.56 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  42.56 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 
257 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
257 aa  194  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 
257 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.8 
 
 
255 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  42.19 
 
 
272 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  43.39 
 
 
253 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
271 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  40.49 
 
 
840 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  40.94 
 
 
257 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  39.68 
 
 
256 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  39.68 
 
 
256 aa  191  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  40.66 
 
 
250 aa  191  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  42.68 
 
 
250 aa  191  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>