More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1904 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  83.87 
 
 		 250 aa  427  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  82.66 
 
 		 250 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  75.79 
 
 		 253 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  71.88 
 
 		 257 aa  361  7.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  56.68 
 
 		 257 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  57.66 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  58.78 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  57.72 
 
 		 252 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  57.09 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  57.79 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  57.09 
 
 		 255 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  56.28 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  56.1 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 		 282 aa  261  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  56.15 
 
 		 245 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  56.97 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  52.48 
 
 		 597 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 256 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  52.42 
 
 		 594 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  49 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  48.37 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  48.59 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  48.59 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  47.56 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  47.37 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.56 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 248 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  48.58 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  47.95 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  48.8 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  48.77 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  47.24 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.97 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  50.81 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.8 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.8 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  46.19 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.87 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  48.58 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.9 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  45.34 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  44.67 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  44.98 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.08 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  43.6 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  45.56 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.22 
 
 		 256 aa  207  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  45.49 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  44.49 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  45.97 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  44.21 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  43.21 
 
 		 840 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  44.49 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  43.72 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  45.75 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.9 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  44.96 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  43.2 
 
 		 838 aa  201  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42.29 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.72 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  41.6 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  46.53 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  41.6 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  41.6 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  43.09 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  47.58 
 
 		 260 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  46.18 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  44.49 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.32 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  41.46 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  44.14 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  44.31 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  45.53 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  44.63 
 
 		 840 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  40.98 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  44.26 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  40.82 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  45.87 
 
 		 852 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  41.87 
 
 		 859 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  40.41 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  42.74 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  43.8 
 
 		 840 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.22 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  44.86 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  40.89 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  40.98 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  43.25 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  42.91 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  44 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  40.48 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>