More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0226 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
271 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  49.01 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.2 
 
 
252 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  48.8 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.05 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.05 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  44.44 
 
 
256 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  42.97 
 
 
252 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  43.78 
 
 
272 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
266 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.6 
 
 
256 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  40.7 
 
 
252 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
254 aa  202  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 
257 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  43.25 
 
 
258 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  43.43 
 
 
250 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  39.92 
 
 
254 aa  199  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  42.86 
 
 
254 aa  198  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  39.68 
 
 
252 aa  198  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  45.91 
 
 
262 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  43.08 
 
 
852 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  43.65 
 
 
256 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  43.6 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  43.03 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  45.91 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  45.91 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  40.78 
 
 
268 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  42.46 
 
 
251 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  42.46 
 
 
251 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  42.63 
 
 
254 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  39.53 
 
 
248 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
254 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  43.03 
 
 
256 aa  195  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.03 
 
 
254 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  40.87 
 
 
267 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.03 
 
 
263 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.24 
 
 
265 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.62 
 
 
261 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
252 aa  193  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  39.76 
 
 
292 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  43.08 
 
 
252 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  41.22 
 
 
271 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.02 
 
 
264 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 
277 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  39.84 
 
 
260 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
255 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  43.87 
 
 
250 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
259 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  39.08 
 
 
261 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
257 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  42.06 
 
 
251 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  43.03 
 
 
256 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  42.63 
 
 
258 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  43.03 
 
 
256 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  39.77 
 
 
261 aa  191  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 
250 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  41.34 
 
 
255 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  40.61 
 
 
278 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  40.87 
 
 
254 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.77 
 
 
259 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  40.8 
 
 
255 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  41.11 
 
 
260 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.5 
 
 
254 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  42.23 
 
 
254 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  43.14 
 
 
246 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  41.56 
 
 
240 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.73 
 
 
255 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  42.86 
 
 
859 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  41.5 
 
 
250 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  41.27 
 
 
250 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  41.27 
 
 
250 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  42.91 
 
 
246 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  41.8 
 
 
256 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  39.31 
 
 
259 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  41.43 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  42.23 
 
 
256 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  41.83 
 
 
268 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  38.22 
 
 
255 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  42.46 
 
 
251 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  38.74 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
250 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  42.29 
 
 
256 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  41.83 
 
 
278 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  40.55 
 
 
260 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  40.47 
 
 
250 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  40.55 
 
 
257 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
259 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  38.46 
 
 
261 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  42.86 
 
 
252 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.7 
 
 
262 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40.87 
 
 
263 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>