More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2064 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  84.21 
 
 		 260 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  82.21 
 
 		 255 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  76.19 
 
 		 292 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  69.02 
 
 		 255 aa  362  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  68.99 
 
 		 254 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.96 
 
 		 254 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  67.83 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  67.83 
 
 		 254 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  68.65 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  45.35 
 
 		 256 aa  224  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  45.35 
 
 		 256 aa  224  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.1 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  44.8 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.31 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.22 
 
 		 272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  44.53 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  46.15 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  47.04 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  45.75 
 
 		 254 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  44.58 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.05 
 
 		 859 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.31 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  43.37 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  45.1 
 
 		 842 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  43.72 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  42.86 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.27 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  42.23 
 
 		 278 aa  198  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.91 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  41.34 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  43.32 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  42.75 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  41.94 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  43.6 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.97 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  41.43 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  44.8 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  39.53 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  41.92 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  42.4 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  41.57 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  40.75 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  40.64 
 
 		 257 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  44.53 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  41.63 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  45.75 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.91 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  42.52 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  40.73 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40.16 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  43.6 
 
 		 250 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.91 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  39.68 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  39.7 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  39.84 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  38.96 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  42.51 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  40.73 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  42.06 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.6 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  42.91 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.08 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  42.13 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  40.49 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  41.73 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  41.7 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  41.32 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  42.46 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  41.3 
 
 		 251 aa  185  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  39.84 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  38.96 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  38.91 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  41.13 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  41.77 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  38.91 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  40.49 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>