More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3755 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  89.58 
 
 		 251 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  89.17 
 
 		 251 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  88.33 
 
 		 251 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  88.75 
 
 		 256 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  86.67 
 
 		 251 aa  434  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  73.75 
 
 		 262 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  73.33 
 
 		 262 aa  362  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  73.33 
 
 		 261 aa  362  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  72.61 
 
 		 252 aa  358  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  65.42 
 
 		 258 aa  347  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  65.83 
 
 		 257 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  65 
 
 		 256 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  66.95 
 
 		 263 aa  342  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  64.17 
 
 		 258 aa  340  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  64.56 
 
 		 263 aa  340  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.56 
 
 		 259 aa  339  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  68.75 
 
 		 256 aa  339  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  64.58 
 
 		 256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  65.4 
 
 		 259 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  65.4 
 
 		 259 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  65.4 
 
 		 259 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  63.71 
 
 		 263 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  64.98 
 
 		 259 aa  337  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  64.98 
 
 		 259 aa  337  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  63.71 
 
 		 259 aa  337  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.71 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.71 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  65.4 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  67.5 
 
 		 252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  64.98 
 
 		 259 aa  335  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  63.71 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  62.92 
 
 		 256 aa  331  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  65.69 
 
 		 250 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  65.42 
 
 		 261 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  66.53 
 
 		 250 aa  330  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  62.87 
 
 		 256 aa  328  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  65.25 
 
 		 256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  63.56 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  62.71 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  63.14 
 
 		 277 aa  325  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  64.56 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  63.56 
 
 		 256 aa  320  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  63.14 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  62.87 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  64.98 
 
 		 255 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  62.71 
 
 		 268 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  60.83 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  62.45 
 
 		 250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  62.45 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  58.75 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  60.25 
 
 		 271 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  58.47 
 
 		 260 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  64.56 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  58.05 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  57.63 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  59.75 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  57.14 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  56.96 
 
 		 258 aa  281  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  58.47 
 
 		 257 aa  275  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  54.58 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  52.92 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  55 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  48.73 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  48.95 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  45.42 
 
 		 859 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  44.3 
 
 		 842 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.08 
 
 		 256 aa  208  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.08 
 
 		 256 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 271 aa  207  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  46.58 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  41.88 
 
 		 249 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  42.31 
 
 		 249 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.44 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  43.85 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  41.03 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  41.45 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.57 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  41.25 
 
 		 840 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  42.02 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  42.8 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  44.87 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  40.68 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.95 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  41.67 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>