More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2988 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  95.2 
 
 		 250 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  83.87 
 
 		 254 aa  427  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  78.26 
 
 		 253 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  72.76 
 
 		 257 aa  364  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  61.38 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  59.44 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  58.47 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  57.26 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  58.3 
 
 		 255 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  57.72 
 
 		 252 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  58.78 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  56.1 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  57.55 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  58.44 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  57.38 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  56.33 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  54.13 
 
 		 597 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  51.2 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  53.06 
 
 		 594 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  49.59 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  48.8 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  49.19 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.97 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  52.03 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  51.63 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  48.19 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  47.18 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  52.05 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  45.75 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  45.71 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  46.75 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  46.5 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  45.78 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.87 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  49.19 
 
 		 246 aa  211  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  48.99 
 
 		 249 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.49 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  47.95 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  45.87 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  47.58 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  44.76 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  46.91 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  46.99 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  47.03 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  44.21 
 
 		 838 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  43.21 
 
 		 840 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  45.38 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  44.67 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  48.98 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  45.27 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  45.87 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  44.86 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  45.27 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  45.27 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  42.51 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.44 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.09 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  47.98 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  41.7 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  44.22 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  47.35 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  41.22 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.31 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  45.45 
 
 		 840 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  43.88 
 
 		 250 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  43.88 
 
 		 250 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  41.7 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.5 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  42.62 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  45.57 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  45.38 
 
 		 840 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.23 
 
 		 484 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  43.88 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  44.76 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  42.63 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  43.59 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.46 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  45.15 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  44.62 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  42.32 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.32 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.15 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  44.02 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  41.8 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  41.22 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  43.37 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>