More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0418 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  100 
 
 
250 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
257 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
257 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  49.79 
 
 
252 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
257 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
257 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 
257 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
257 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
257 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 
257 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
257 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  48.18 
 
 
267 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  44.94 
 
 
257 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7911  ABC transporter related  51.38 
 
 
264 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  48.98 
 
 
254 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  47.95 
 
 
263 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  48.15 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0039  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
290 aa  214  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0187406  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0075  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  51.82 
 
 
257 aa  214  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  47.13 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  46.59 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  46.34 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.95 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  42.57 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  46.34 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  46.15 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 
250 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  45.75 
 
 
250 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  46.94 
 
 
250 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  47.35 
 
 
254 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  45.16 
 
 
258 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
254 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  45.56 
 
 
257 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  47.01 
 
 
260 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  46.31 
 
 
251 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  46.72 
 
 
251 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  47.35 
 
 
254 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  44.72 
 
 
258 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  44 
 
 
271 aa  208  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  45.71 
 
 
245 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  46.34 
 
 
263 aa  208  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  45.53 
 
 
255 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  46.94 
 
 
278 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  45.08 
 
 
253 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 
277 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  46.96 
 
 
268 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  46.72 
 
 
251 aa  204  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
256 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  45.49 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  46.31 
 
 
256 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  45.56 
 
 
266 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  45.2 
 
 
246 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  44.94 
 
 
255 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  46.15 
 
 
257 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  45.73 
 
 
258 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  46.72 
 
 
252 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.08 
 
 
263 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.16 
 
 
256 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  44.8 
 
 
252 aa  201  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
259 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
259 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
259 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
259 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  47.37 
 
 
273 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  46 
 
 
252 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  44.67 
 
 
251 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
259 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
259 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
259 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.78 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.72 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  42.34 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  45.9 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  46.72 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  44.72 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  45.78 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  44.72 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  44.72 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  40.73 
 
 
249 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  45.49 
 
 
256 aa  198  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  40.94 
 
 
252 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  44.67 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  44.67 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  44.67 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  44.67 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  48.16 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.94 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  48.16 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.76 
 
 
859 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  45.12 
 
 
261 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.13 
 
 
249 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  43.85 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  40.73 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  46.12 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  45.16 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>