More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0791 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 248 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  70.61 
 
 		 250 aa  355  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  70.78 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  54.1 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  53.69 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  51.64 
 
 		 249 aa  251  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  53.88 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  51.44 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  54.51 
 
 		 254 aa  244  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  53.88 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  50.21 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  51.03 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  48.58 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  51.82 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  53.82 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  49.8 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  51.23 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  55.56 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  53.91 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  49.8 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  52.52 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  56.1 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  52.87 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  49.39 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  53.06 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  51.79 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  49.59 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  50.62 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  49.8 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  49.8 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  46.94 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  49.59 
 
 		 249 aa  221  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  47.79 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  48.32 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  45.31 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  46.22 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  45.93 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  46.75 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  44.9 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.9 
 
 		 266 aa  209  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  50.61 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  51.63 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  47.74 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  44.81 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  44.08 
 
 		 254 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  43.27 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.74 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  44.31 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  45.1 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  47.35 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  41.98 
 
 		 625 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  47.35 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  47.35 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  45.93 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.03 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  44.44 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  44.44 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  45.12 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.72 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  46.47 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  45.04 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.67 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.67 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.5 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  46.75 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  43.27 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  45.49 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  46.69 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  44.81 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  45.31 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  45.93 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  46.12 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  44.03 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  45.31 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  43.32 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  45.71 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  43.03 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  44.63 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  44.03 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  45.56 
 
 		 594 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.9 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  45.38 
 
 		 597 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  43.95 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  45.87 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  42.8 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.37 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  43.9 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>