More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1075 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  92.72 
 
 		 268 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  89.88 
 
 		 257 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  77.19 
 
 		 277 aa  424  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  79.53 
 
 		 256 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  78.12 
 
 		 258 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  77.56 
 
 		 256 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  77.17 
 
 		 256 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  76.65 
 
 		 257 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  77.95 
 
 		 256 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  75.59 
 
 		 258 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  75.98 
 
 		 256 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  76.95 
 
 		 263 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  76.95 
 
 		 259 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  73.33 
 
 		 256 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  72.94 
 
 		 256 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  73.62 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  72.55 
 
 		 256 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  75.72 
 
 		 263 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  76.54 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.9 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  76.13 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  76.54 
 
 		 259 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  76.54 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  76.54 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  76.13 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  76.54 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.9 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  72.59 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.9 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  73.47 
 
 		 253 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  73.88 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  72.24 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  70.45 
 
 		 250 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  70.47 
 
 		 256 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  70.04 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  67.45 
 
 		 256 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  68.44 
 
 		 250 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  68.44 
 
 		 250 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  63.86 
 
 		 256 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  64.75 
 
 		 251 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  63.16 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  66.12 
 
 		 262 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  62.35 
 
 		 251 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  61.94 
 
 		 251 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  61.63 
 
 		 250 aa  322  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  65.31 
 
 		 262 aa  322  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  65.31 
 
 		 261 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  68.44 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  64.11 
 
 		 252 aa  317  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  63.14 
 
 		 240 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  62.55 
 
 		 252 aa  315  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  62.86 
 
 		 250 aa  314  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.62 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  57.94 
 
 		 257 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.94 
 
 		 257 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  59.26 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  59.26 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  58.44 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  58.3 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.6 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  55.69 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  58.33 
 
 		 257 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  51.45 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 248 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  51.02 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  50.2 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  44.81 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  45.23 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  46.18 
 
 		 256 aa  215  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  46.09 
 
 		 842 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  46.69 
 
 		 859 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  45.64 
 
 		 253 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  44.8 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.98 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  40.71 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  44 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  44.26 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  44.81 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  43.39 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.45 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.77 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  44.67 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  46.94 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  44.62 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  42.23 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.15 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.66 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  42.35 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  45.9 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  43.39 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>