More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2517 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  94.82 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  92.83 
 
 		 251 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  91.63 
 
 		 251 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  88.05 
 
 		 251 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  88.75 
 
 		 240 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  74.7 
 
 		 262 aa  377  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  74.3 
 
 		 261 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  74.3 
 
 		 262 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  71.71 
 
 		 252 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  67.48 
 
 		 258 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  67.61 
 
 		 257 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  65.61 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  67.61 
 
 		 256 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  67.61 
 
 		 256 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  64.82 
 
 		 263 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  66.12 
 
 		 258 aa  351  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  66.12 
 
 		 259 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.53 
 
 		 259 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  68.42 
 
 		 250 aa  350  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  67.35 
 
 		 263 aa  349  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 		 256 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  67.35 
 
 		 259 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  67.35 
 
 		 259 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  67.35 
 
 		 259 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  67.35 
 
 		 259 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  66.94 
 
 		 259 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  66.94 
 
 		 259 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.71 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.71 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.71 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.71 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.71 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.71 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.71 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  66.53 
 
 		 261 aa  345  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  66.94 
 
 		 259 aa  345  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  63.92 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  67.21 
 
 		 252 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  63.45 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  65.06 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  66.8 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  65.46 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  64.52 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  64.75 
 
 		 256 aa  334  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  63.86 
 
 		 256 aa  334  9e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  66.53 
 
 		 255 aa  333  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  63.86 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  62.9 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  62.65 
 
 		 256 aa  331  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  63.86 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  63.45 
 
 		 255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  63.11 
 
 		 257 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  62.45 
 
 		 250 aa  307  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  62.45 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  59.92 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  58.66 
 
 		 271 aa  301  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 271 aa  301  9e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  59.26 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 271 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  59.26 
 
 		 260 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  58.13 
 
 		 261 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.57 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  64.11 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.61 
 
 		 257 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  57.61 
 
 		 257 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  57.79 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  59.67 
 
 		 257 aa  284  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  53.63 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  55.69 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  52.02 
 
 		 253 aa  242  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  49.79 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  48.37 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  46.75 
 
 		 859 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  47.11 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.13 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.13 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.31 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  45.27 
 
 		 842 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.9 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  47.13 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  41.91 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  45.53 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.08 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  40.66 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  44.67 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  41.49 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.57 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  44.92 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  44.4 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  38.71 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  42.98 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  42.17 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  40.73 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>