More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0039 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0039  ABC transporter related protein  100 
 
 
290 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0187406  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0075  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  82.72 
 
 
257 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7911  ABC transporter related  60.56 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  51.84 
 
 
250 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  49.6 
 
 
252 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
257 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
257 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
257 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
257 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
257 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  42.45 
 
 
257 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
257 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  46.31 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  46.94 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  42.51 
 
 
250 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  46.18 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  44.86 
 
 
254 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  44.44 
 
 
254 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  44.03 
 
 
254 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  44.31 
 
 
250 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  42.91 
 
 
251 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  43.27 
 
 
258 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  40.24 
 
 
254 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  40.39 
 
 
257 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  41.53 
 
 
859 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  40.24 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.46 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  42.31 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  43.5 
 
 
252 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  43.32 
 
 
260 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
249 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  39.22 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
250 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  43.03 
 
 
255 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
266 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  41.86 
 
 
278 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  39.84 
 
 
269 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  44.21 
 
 
272 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  41.6 
 
 
256 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  37.92 
 
 
284 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  41.6 
 
 
256 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  38.4 
 
 
254 aa  179  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  40.89 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  39.59 
 
 
250 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
250 aa  179  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  41.7 
 
 
256 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  37.55 
 
 
284 aa  178  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  41.06 
 
 
270 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  36.9 
 
 
266 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.24 
 
 
251 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  44.08 
 
 
252 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  43.95 
 
 
249 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  40.68 
 
 
294 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  42.62 
 
 
260 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  43.15 
 
 
260 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  40.57 
 
 
260 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  37.94 
 
 
256 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.15 
 
 
250 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
255 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  36.89 
 
 
249 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  34.92 
 
 
252 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  38.04 
 
 
269 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  43.37 
 
 
249 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  36.88 
 
 
280 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  39.68 
 
 
271 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  43.39 
 
 
253 aa  176  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  40.56 
 
 
261 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  41.39 
 
 
484 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  41.31 
 
 
277 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  41.63 
 
 
261 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
271 aa  175  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  41.09 
 
 
273 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4380  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
251 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.794104  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  40.4 
 
 
253 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0668  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.89 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.21 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  44.26 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
256 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  39.43 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  42.21 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  40.82 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  44.76 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  37.8 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  39.29 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  37.15 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  38.37 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  39.44 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  38.34 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  41.13 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
256 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  32.54 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  40.74 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>