More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3527 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  90.66 
 
 		 268 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  89.88 
 
 		 278 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  77.95 
 
 		 258 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  76.65 
 
 		 257 aa  407  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  76.38 
 
 		 256 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  75.88 
 
 		 277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  74.9 
 
 		 256 aa  400  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  75.19 
 
 		 258 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  75.2 
 
 		 256 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 256 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  76.38 
 
 		 256 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  74.02 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  74.51 
 
 		 256 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  74.41 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  73.23 
 
 		 256 aa  387  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  74.52 
 
 		 261 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  76.54 
 
 		 263 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  76.54 
 
 		 259 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  76.13 
 
 		 259 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  76.13 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  75.31 
 
 		 263 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  76.13 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  71.66 
 
 		 250 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  76.13 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  75.72 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  76.13 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  75.72 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.66 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.66 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  72.06 
 
 		 255 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.66 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.66 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.66 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.66 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.66 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.66 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  73.47 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 		 256 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  71.84 
 
 		 255 aa  357  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  68.67 
 
 		 263 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  68.67 
 
 		 256 aa  353  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  67.21 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  67.21 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  67.21 
 
 		 262 aa  334  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  65.59 
 
 		 262 aa  329  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  64.37 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  65.71 
 
 		 261 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  63.11 
 
 		 256 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  64.29 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  61.22 
 
 		 250 aa  322  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  67.61 
 
 		 250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  61.54 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  61.13 
 
 		 251 aa  317  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  61.94 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  61.69 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  60.83 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  60.73 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.16 
 
 		 255 aa  295  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  59.35 
 
 		 257 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  59.35 
 
 		 257 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  58.44 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  59.35 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 		 271 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  55.47 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 		 271 aa  278  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  58.26 
 
 		 271 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  56.73 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  56.33 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  51.59 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  50.79 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  49.59 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  55.1 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  46.56 
 
 		 859 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  46.09 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  43.67 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  45.16 
 
 		 842 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  44.08 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  45.53 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  44.9 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.67 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.45 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  45.38 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  41.2 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.35 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.35 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  42.51 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.44 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  44.9 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  43.15 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  40.73 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.8 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  43.88 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.62 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.62 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>