More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1822 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  490  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  99.6 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  82 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  69.51 
 
 		 258 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  69.08 
 
 		 257 aa  357  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  69.48 
 
 		 277 aa  354  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  69.11 
 
 		 256 aa  354  6.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  69.11 
 
 		 256 aa  353  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  69.11 
 
 		 259 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.11 
 
 		 259 aa  352  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  67.89 
 
 		 263 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  68.7 
 
 		 259 aa  351  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  68.7 
 
 		 259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  68.7 
 
 		 259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  68.7 
 
 		 259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  67.89 
 
 		 259 aa  351  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  67.47 
 
 		 256 aa  350  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  68.29 
 
 		 259 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  67.47 
 
 		 256 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  68.29 
 
 		 259 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.29 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.29 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  70.04 
 
 		 250 aa  349  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.29 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.29 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.29 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.29 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.29 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  68.29 
 
 		 263 aa  348  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  68.95 
 
 		 263 aa  348  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  67.62 
 
 		 258 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  67.07 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 		 256 aa  345  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  68.44 
 
 		 278 aa  345  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  67.07 
 
 		 268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  68.7 
 
 		 255 aa  341  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  66.26 
 
 		 256 aa  341  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  67.21 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  65.57 
 
 		 256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  67.47 
 
 		 261 aa  338  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  67.48 
 
 		 256 aa  335  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  67.35 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  67.35 
 
 		 255 aa  331  7.000000000000001e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  63.82 
 
 		 250 aa  325  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  66.12 
 
 		 256 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  63.01 
 
 		 256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  64.49 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  65.85 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  65.32 
 
 		 261 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  65.45 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  62.9 
 
 		 251 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  62.5 
 
 		 251 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  61.69 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  62.9 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  62.45 
 
 		 256 aa  307  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  62.45 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  63.86 
 
 		 252 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  64.73 
 
 		 250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.08 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  59.5 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  59.67 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  58.78 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  59.5 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  59.5 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  58.68 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  60.74 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  58.68 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  55.06 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  58.02 
 
 		 248 aa  241  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  55.02 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  53.41 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.79 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  44.86 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  46.94 
 
 		 859 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  45.23 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.98 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  44.72 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  45.23 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.73 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  45.87 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  43.85 
 
 		 256 aa  198  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  43.85 
 
 		 256 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  41.2 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  42.86 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  42.8 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  45.93 
 
 		 266 aa  194  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.8 
 
 		 266 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.62 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  43.6 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.44 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  42.86 
 
 		 842 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  42.51 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  43.87 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>