More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3246 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  95.62 
 
 
262 aa  493  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  94.14 
 
 
261 aa  487  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  90.73 
 
 
252 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  74.3 
 
 
256 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  73.9 
 
 
251 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  73.09 
 
 
251 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  74.7 
 
 
251 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  73.09 
 
 
251 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  70.73 
 
 
263 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  73.33 
 
 
240 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  71.49 
 
 
250 aa  361  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  70.33 
 
 
259 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  70.33 
 
 
259 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  69.92 
 
 
259 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  69.92 
 
 
259 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  69.92 
 
 
259 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  69.92 
 
 
259 aa  357  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.11 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.11 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.51 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  69.51 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  69.51 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  69.51 
 
 
259 aa  353  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  68.7 
 
 
257 aa  353  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  67.89 
 
 
258 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  67.48 
 
 
258 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  67.76 
 
 
256 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  69.11 
 
 
261 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  66.27 
 
 
256 aa  346  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  70.97 
 
 
256 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  67.76 
 
 
256 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  68.98 
 
 
250 aa  346  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  66.94 
 
 
263 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  67.76 
 
 
256 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  69.35 
 
 
252 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  65.86 
 
 
256 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  67.07 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  65.06 
 
 
256 aa  338  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  69.11 
 
 
255 aa  337  8e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  63.57 
 
 
277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  67.21 
 
 
257 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  64.9 
 
 
256 aa  332  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  66.12 
 
 
278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  64.66 
 
 
256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  65.71 
 
 
268 aa  325  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  63.86 
 
 
253 aa  325  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  66.26 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  65.85 
 
 
250 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  62.65 
 
 
255 aa  315  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  65.85 
 
 
250 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  64.52 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  62.2 
 
 
261 aa  298  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  59.25 
 
 
271 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.35 
 
 
271 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  61.79 
 
 
257 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  61.79 
 
 
257 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.94 
 
 
271 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  66.53 
 
 
250 aa  294  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.91 
 
 
255 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  60.78 
 
 
260 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  59.61 
 
 
260 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  60.64 
 
 
258 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  62.2 
 
 
257 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  57.79 
 
 
253 aa  261  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  57.38 
 
 
253 aa  258  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  55.87 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  51.48 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  45.56 
 
 
859 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
250 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  45.34 
 
 
256 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  45.34 
 
 
256 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  49.38 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.98 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.75 
 
 
256 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  45.34 
 
 
252 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  45.87 
 
 
249 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  43.92 
 
 
842 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.03 
 
 
250 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
250 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  43.67 
 
 
250 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  43.67 
 
 
251 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
266 aa  205  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0501  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.76 
 
 
264 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942704  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  44.53 
 
 
250 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  45.04 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  42.91 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.51 
 
 
269 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  46.77 
 
 
266 aa  199  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.6 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  43.37 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  42.21 
 
 
258 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>