More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0006 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  89.33 
 
 
253 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  75.9 
 
 
258 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  77.24 
 
 
256 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  77.24 
 
 
256 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  74.7 
 
 
258 aa  387  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  74.8 
 
 
256 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  74.7 
 
 
259 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.5 
 
 
259 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  75.2 
 
 
256 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  74.7 
 
 
259 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  76.42 
 
 
257 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  74.7 
 
 
259 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  74.7 
 
 
259 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  76.61 
 
 
277 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  74.3 
 
 
259 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.7 
 
 
259 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.7 
 
 
259 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.7 
 
 
259 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  74.3 
 
 
259 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.7 
 
 
259 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.7 
 
 
259 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.7 
 
 
259 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.7 
 
 
259 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  75.2 
 
 
256 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  74.3 
 
 
259 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  75.61 
 
 
256 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  74 
 
 
256 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  73.9 
 
 
263 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  73.9 
 
 
259 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  74.7 
 
 
263 aa  370  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  71.89 
 
 
263 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  73.88 
 
 
278 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  73.6 
 
 
256 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  73.06 
 
 
268 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  71.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  69.64 
 
 
256 aa  357  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  71.84 
 
 
257 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  68.98 
 
 
250 aa  344  6e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  70.12 
 
 
256 aa  341  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  67.21 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  67.76 
 
 
250 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  67.35 
 
 
250 aa  331  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  64.23 
 
 
256 aa  330  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  63.45 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  59.6 
 
 
250 aa  321  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  60.96 
 
 
252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  62.5 
 
 
251 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  62.87 
 
 
240 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  63.05 
 
 
251 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  61.69 
 
 
251 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  61.45 
 
 
251 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  63.45 
 
 
262 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  63.2 
 
 
261 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  62.65 
 
 
262 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  62.04 
 
 
250 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  61.94 
 
 
252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  59.59 
 
 
271 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  64.23 
 
 
250 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
271 aa  295  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 
271 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  58.44 
 
 
261 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  57.61 
 
 
257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.61 
 
 
257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  56.79 
 
 
260 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  56.38 
 
 
260 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  58.85 
 
 
257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  55.51 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.96 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  54.29 
 
 
253 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  57.85 
 
 
248 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  52.54 
 
 
252 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  51.02 
 
 
253 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
266 aa  215  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  43.9 
 
 
250 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.31 
 
 
254 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  47.68 
 
 
272 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  45.53 
 
 
256 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  44.31 
 
 
842 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  46.34 
 
 
859 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.5 
 
 
254 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  44.3 
 
 
249 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  44.3 
 
 
249 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  43.21 
 
 
249 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.9 
 
 
250 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.95 
 
 
266 aa  202  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  43.37 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  44.73 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  43.09 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  41.53 
 
 
253 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.68 
 
 
256 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.28 
 
 
256 aa  198  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.28 
 
 
256 aa  198  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.9 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  41.77 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  42.28 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>