More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3520 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  96.88 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  91.76 
 
 		 258 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  86.27 
 
 		 256 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  85.88 
 
 		 256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  85.49 
 
 		 256 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  84.65 
 
 		 256 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  83.27 
 
 		 277 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  83.86 
 
 		 256 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  83.86 
 
 		 256 aa  444  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  81.89 
 
 		 256 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  79.92 
 
 		 256 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  80.82 
 
 		 259 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  80.82 
 
 		 263 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.22 
 
 		 259 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  76.65 
 
 		 278 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  76.65 
 
 		 257 aa  407  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  75.88 
 
 		 268 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.59 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.59 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.59 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  79.18 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  78.78 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.59 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  79.18 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.59 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.59 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  79.18 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  79.18 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  78.78 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  79.18 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  79.59 
 
 		 263 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  79.59 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  74.8 
 
 		 256 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  76.61 
 
 		 263 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  76.83 
 
 		 253 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  74.13 
 
 		 261 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  75.3 
 
 		 250 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  76.42 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  72.18 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 		 256 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  69.84 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  69.64 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  69.08 
 
 		 250 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  69.08 
 
 		 250 aa  357  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  67.61 
 
 		 256 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  67.21 
 
 		 251 aa  354  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  68.98 
 
 		 262 aa  352  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  66.13 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  69.11 
 
 		 261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  69.39 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  67.21 
 
 		 251 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  65.83 
 
 		 240 aa  346  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  65.87 
 
 		 252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  62.86 
 
 		 250 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  68.42 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  65.98 
 
 		 250 aa  332  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  62.25 
 
 		 252 aa  328  7e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.22 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  60.98 
 
 		 257 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  60.98 
 
 		 257 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  60.49 
 
 		 261 aa  304  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  59.18 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  58.8 
 
 		 260 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  61.38 
 
 		 257 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 		 271 aa  298  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  58.85 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  58.4 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  54.58 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  52.23 
 
 		 252 aa  262  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  53.78 
 
 		 253 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.79 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  45.34 
 
 		 842 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  45.9 
 
 		 859 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  44.86 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.4 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  42.8 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  44.53 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.56 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  43.36 
 
 		 278 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  43.5 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  44.08 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  44.05 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  42.34 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  42.23 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  42.23 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.8 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  43.65 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  43.41 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  43.65 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.21 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.21 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>