More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1049 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  98.03 
 
 
254 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.61 
 
 
265 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  49.18 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.15 
 
 
250 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.02 
 
 
264 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.15 
 
 
272 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  44.9 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  48.16 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  44.08 
 
 
277 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.53 
 
 
256 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  45.49 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  43.7 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
250 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
250 aa  214  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  45.19 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.95 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  44.03 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.62 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  42.86 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  42.57 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  44.08 
 
 
250 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.5 
 
 
263 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.87 
 
 
254 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  43.43 
 
 
275 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  42.17 
 
 
255 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  44.31 
 
 
255 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  44.72 
 
 
255 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  46.94 
 
 
250 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 
249 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.03 
 
 
266 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  43.62 
 
 
249 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  46.9 
 
 
257 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  46.94 
 
 
249 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  43.9 
 
 
263 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 
257 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  43.25 
 
 
278 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  43.5 
 
 
256 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  43.15 
 
 
269 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  45.53 
 
 
252 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  43.5 
 
 
256 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  41.63 
 
 
256 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  43.5 
 
 
256 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  43.5 
 
 
256 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  46.06 
 
 
261 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  44.08 
 
 
256 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  44.08 
 
 
253 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  42.23 
 
 
262 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.51 
 
 
266 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  44.17 
 
 
244 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  42.4 
 
 
258 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  43.32 
 
 
268 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  41.63 
 
 
256 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  43.97 
 
 
254 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.51 
 
 
269 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  42.34 
 
 
258 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  42 
 
 
259 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 
264 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  43.87 
 
 
257 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
256 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  47.3 
 
 
255 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
251 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  43.62 
 
 
252 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  42.51 
 
 
268 aa  205  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  42.23 
 
 
271 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  43.58 
 
 
254 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  41.6 
 
 
253 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  41.6 
 
 
257 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  42.86 
 
 
250 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.1 
 
 
271 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.68 
 
 
259 aa  204  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  42.68 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  43.28 
 
 
268 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  42.68 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  41.13 
 
 
251 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  42.68 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  42.68 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  42.68 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  42.68 
 
 
259 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  44.76 
 
 
250 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  42.29 
 
 
255 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  42.28 
 
 
260 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  42.28 
 
 
260 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 
259 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  41.46 
 
 
252 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.58 
 
 
254 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  42.64 
 
 
256 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  41.77 
 
 
278 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.86 
 
 
250 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  43.08 
 
 
257 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  39.75 
 
 
249 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  42.74 
 
 
266 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
259 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
259 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
259 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
259 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
259 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>