More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0659 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  94.05 
 
 		 269 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  79.22 
 
 		 265 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  70.75 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  69.11 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  66.67 
 
 		 536 aa  340  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  59.6 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.64 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  60.32 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0156  ABC transporter related  62.2 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  59.02 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0174  ABC transporter related  61.63 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  58.61 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0585  ABC transporter component  49.17 
 
 		 259 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.51 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.11 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  44.21 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  46.94 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  43.32 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  43.32 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.14 
 
 		 265 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.27 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  43.46 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  40.4 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  42.28 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  42.51 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.35 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  43.82 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  40.08 
 
 		 840 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 257 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  42.11 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 271 aa  194  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  38.81 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  41.15 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  42.69 
 
 		 852 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  41.3 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.24 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  40.48 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  42.56 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.2 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  39.31 
 
 		 840 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  39.53 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  41.7 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  39.43 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  39.43 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  39.02 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  39.84 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  39.02 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  42.91 
 
 		 590 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  39.27 
 
 		 840 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  38.74 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.27 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  43.43 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  40.62 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  37.69 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03304  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0260  ABC transporter related protein  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  38.78 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3867  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  40.65 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3653  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  40.32 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3934  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4772  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3737  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03257  hypothetical protein  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  40.55 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0261  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  39.43 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>