More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3736 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  64.14 
 
 		 256 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  64.14 
 
 		 256 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  63.35 
 
 		 256 aa  331  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  63.45 
 
 		 252 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  65.59 
 
 		 260 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  59.49 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.53 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  45.87 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  45.45 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  45.45 
 
 		 254 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  44.72 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  45.16 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  44.58 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  43.15 
 
 		 859 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  44.27 
 
 		 272 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  44.84 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  42.97 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.02 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 271 aa  208  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  46.46 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  45.42 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  44.58 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  42.44 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.31 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.28 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44.31 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  42.44 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  42.86 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  42.17 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.21 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  44.09 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  43.1 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  46.5 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  41.6 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.21 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.13 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  41.13 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.32 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  44.49 
 
 		 594 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  43.32 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.53 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  38.31 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.39 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  41.18 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.51 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  43.16 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  40.32 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03304  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0260  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3934  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03257  hypothetical protein  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3867  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0261  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3737  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4772  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  41.94 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  41.56 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  41.94 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3653  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  41.94 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.11 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  42.8 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  43.62 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.95 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  42.97 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  39.6 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.86 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.86 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40.41 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.86 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3858  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.86 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.199683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.86 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  42.51 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  45.31 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  41.13 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  38.8 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  44.94 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.86 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  39.84 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.73 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  44.76 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.3 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  40.24 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>