More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6490 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  48.25 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  49.12 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  45.61 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  47.14 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.17 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  47.16 
 
 		 536 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  45.61 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  45.85 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  45.85 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.46 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.96 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  43.46 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0156  ABC transporter related  46.49 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  43.04 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  42.68 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  42.15 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.29 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0174  ABC transporter related  46.05 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159658  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  40.66 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  43.23 
 
 		 859 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  41.08 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  43.86 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  45.37 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.48 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  44.86 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  45.57 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  41.7 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  41.98 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  42.67 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  46.52 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  39.92 
 
 		 249 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.05 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  39.92 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  42.11 
 
 		 260 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  43.64 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  36.44 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  42.15 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  39.5 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  42.37 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  41.56 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  41.49 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  40.32 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.92 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  40.08 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  41.15 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  42.11 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  42.74 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  43.03 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.48 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.99 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.17 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  41.56 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  43.04 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.31 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  40 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  42.29 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  42.73 
 
 		 278 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  41.32 
 
 		 256 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  41.32 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  41.53 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  42.73 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  40.66 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.34 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  40.66 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  45.64 
 
 		 549 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  44.35 
 
 		 842 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  43.59 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  42.17 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  37.45 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  40.33 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  40.74 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  41.87 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  43.53 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  46.09 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  41.6 
 
 		 840 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  41.74 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  39.74 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  43.48 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38.33 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  42.55 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40.17 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  41.67 
 
 		 852 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>