More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2762 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  98.44 
 
 
256 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  97.66 
 
 
256 aa  503  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  94.92 
 
 
256 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  93.36 
 
 
256 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  59.2 
 
 
252 aa  295  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  59.92 
 
 
251 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  59.27 
 
 
252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  42.07 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  42.07 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  43.82 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.22 
 
 
264 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  43.03 
 
 
272 aa  208  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  43.48 
 
 
255 aa  207  9e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.43 
 
 
265 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 
256 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  43.03 
 
 
249 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  42.02 
 
 
278 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  43.57 
 
 
249 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.4 
 
 
258 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  43.15 
 
 
249 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.43 
 
 
254 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  42.8 
 
 
261 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.02 
 
 
252 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.95 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  41.39 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
250 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
250 aa  198  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  41.77 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  40.94 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  42.8 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  43.36 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  43.36 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.09 
 
 
252 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  43.2 
 
 
265 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  43.2 
 
 
265 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  40 
 
 
256 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  39.84 
 
 
255 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  39.92 
 
 
256 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  41.27 
 
 
256 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.34 
 
 
258 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.73 
 
 
258 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  43.55 
 
 
251 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.73 
 
 
258 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.73 
 
 
258 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  43.72 
 
 
268 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  41.11 
 
 
256 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 
254 aa  192  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  42.23 
 
 
283 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  42.8 
 
 
250 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  41.46 
 
 
608 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  43.08 
 
 
590 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  43.27 
 
 
242 aa  191  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  40.16 
 
 
257 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
257 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  40.24 
 
 
254 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  42.4 
 
 
250 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.75 
 
 
333 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 
253 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  41.34 
 
 
258 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
276 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  42.86 
 
 
280 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  41.43 
 
 
254 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  41.77 
 
 
252 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  40.32 
 
 
249 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  41.04 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  40.24 
 
 
252 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  39.84 
 
 
254 aa  189  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 
293 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  42.19 
 
 
258 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  40.94 
 
 
258 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  42.91 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  40.73 
 
 
265 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  39.27 
 
 
258 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
617 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
256 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  40.08 
 
 
259 aa  188  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  39.52 
 
 
269 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  39.52 
 
 
256 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  40.4 
 
 
594 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.28 
 
 
250 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  40.55 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.02 
 
 
269 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  42.19 
 
 
262 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  39.36 
 
 
256 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  41.53 
 
 
257 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  40.32 
 
 
256 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  40 
 
 
250 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
294 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  39.13 
 
 
281 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  40.23 
 
 
265 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  38.25 
 
 
255 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  39.84 
 
 
251 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  41.8 
 
 
257 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 
259 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 
258 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  39.68 
 
 
253 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>