More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0156 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0156  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0174  ABC transporter related  98.02 
 
 		 250 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  63.75 
 
 		 268 aa  336  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  65.34 
 
 		 259 aa  332  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  64.63 
 
 		 265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  64.66 
 
 		 536 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  63.41 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.2 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  62.2 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  62.45 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.7 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  62.6 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  60.57 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0585  ABC transporter component  52.89 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  49.18 
 
 		 252 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  46.49 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.57 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1617  ABC transporter related  51.63 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0412041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.97 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  42.8 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42.29 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  39.92 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  39.92 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  41.74 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  43.67 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3083  ABC transporter related  48.81 
 
 		 254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.179778  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  42.45 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  43.87 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  39.51 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.62 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  39.09 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  44.53 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  43.37 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  44.84 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  42.74 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  44.84 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  44.05 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  39.68 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  40.24 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  43.09 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.37 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.46 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  44 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.93 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.93 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  42 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  43.03 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  44.72 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  42.39 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  41.37 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  45.31 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  42.69 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  39.59 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  42.46 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  37.69 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  43.31 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  41.63 
 
 		 621 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  41.98 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  39.84 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  41.94 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  41.39 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  39.52 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  40.65 
 
 		 625 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  44.23 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.06 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  39.29 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  40.82 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  38.11 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.46 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  39.53 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  38.62 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  43.72 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  38.62 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>