More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2727 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  90.8 
 
 
265 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  85.94 
 
 
268 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  80.4 
 
 
253 aa  410  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  77.73 
 
 
261 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  60.73 
 
 
250 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  61.13 
 
 
250 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  59.92 
 
 
250 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 
248 aa  295  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  52.99 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
257 aa  258  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  50 
 
 
257 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  50 
 
 
257 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  52 
 
 
250 aa  251  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 
250 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.82 
 
 
247 aa  245  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  50.21 
 
 
251 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  48.4 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  45.78 
 
 
254 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  45.6 
 
 
254 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  45.87 
 
 
254 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  44.63 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 
248 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  42.8 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.17 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.02 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.02 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.02 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.62 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  39.69 
 
 
266 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
247 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.6 
 
 
251 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  42.45 
 
 
260 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  41.22 
 
 
250 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  41.15 
 
 
249 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  38.62 
 
 
251 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
257 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  44.31 
 
 
257 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  39.29 
 
 
263 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  44.44 
 
 
249 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 
255 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  42.23 
 
 
840 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
249 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
249 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40 
 
 
263 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  39.67 
 
 
245 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  40.33 
 
 
249 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  42.04 
 
 
261 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
255 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.8 
 
 
265 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  38.21 
 
 
251 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  41.22 
 
 
250 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  40.08 
 
 
250 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 
249 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.63 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.6 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  38.37 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  38.21 
 
 
256 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
255 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.63 
 
 
255 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  37.8 
 
 
251 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.63 
 
 
255 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  41.15 
 
 
246 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.18 
 
 
254 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  38.82 
 
 
258 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
259 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  40.16 
 
 
259 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  39.43 
 
 
251 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  40.16 
 
 
259 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  39.78 
 
 
284 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  40.16 
 
 
259 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
252 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  38.78 
 
 
256 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  42.11 
 
 
271 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  38.96 
 
 
249 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  39.75 
 
 
259 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.74 
 
 
240 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  42.57 
 
 
251 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  41.22 
 
 
260 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.75 
 
 
252 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  38.78 
 
 
259 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  39.75 
 
 
259 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.06 
 
 
256 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  42.17 
 
 
251 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.41 
 
 
264 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  40.41 
 
 
256 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  40.8 
 
 
264 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  39.92 
 
 
253 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  38.78 
 
 
256 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  41.53 
 
 
852 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  39.78 
 
 
284 aa  186  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>