More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4328 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  100 
 
 
269 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  94.05 
 
 
269 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  79.61 
 
 
265 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  69.5 
 
 
259 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  71.15 
 
 
268 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  67.86 
 
 
536 aa  342  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  60.8 
 
 
260 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  60.73 
 
 
260 aa  298  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0156  ABC transporter related  63.41 
 
 
252 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  59.84 
 
 
260 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0174  ABC transporter related  62.86 
 
 
250 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  59.84 
 
 
259 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0585  ABC transporter component  50.41 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.53 
 
 
252 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  44.21 
 
 
249 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.15 
 
 
254 aa  205  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  44.49 
 
 
263 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  43.32 
 
 
261 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  43.32 
 
 
262 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  42.91 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.53 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.74 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  41.06 
 
 
250 aa  198  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  40 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.14 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  43.43 
 
 
271 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  43.46 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  39.18 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  42.11 
 
 
252 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 
255 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 
255 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  41.15 
 
 
267 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  39.69 
 
 
840 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  42.13 
 
 
261 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 
255 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 
255 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  45.42 
 
 
254 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.43 
 
 
254 aa  192  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
255 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  43.43 
 
 
852 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
255 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  40.49 
 
 
253 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  41.41 
 
 
251 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  42.91 
 
 
590 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 
255 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  39.11 
 
 
251 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  37.69 
 
 
271 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  40.89 
 
 
255 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  39.92 
 
 
256 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  42.74 
 
 
250 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  41.11 
 
 
256 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  42.02 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  39.92 
 
 
256 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  39.84 
 
 
256 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  39.52 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.23 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  38.65 
 
 
252 aa  188  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  40.48 
 
 
266 aa  188  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
255 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
257 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
589 aa  188  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 
257 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.5 
 
 
257 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
257 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
257 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 
254 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  42.35 
 
 
272 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3724  ABC transporter component  41.77 
 
 
260 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  42.15 
 
 
245 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  39.52 
 
 
256 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  39.84 
 
 
251 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  39.84 
 
 
251 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  39.43 
 
 
251 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  41.11 
 
 
252 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  41.2 
 
 
271 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  38.06 
 
 
284 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  38.93 
 
 
268 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3083  ABC transporter related  45.6 
 
 
254 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.179778  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1617  ABC transporter related  46.09 
 
 
252 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0412041  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  39.43 
 
 
251 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  41.2 
 
 
256 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.63 
 
 
256 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 
261 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  41 
 
 
272 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  43.03 
 
 
262 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
257 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 
257 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  41.87 
 
 
255 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  39.84 
 
 
250 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  42.34 
 
 
250 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  38.93 
 
 
251 aa  185  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
256 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  38.4 
 
 
266 aa  185  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.2 
 
 
333 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.43 
 
 
256 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
255 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 
257 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  39.18 
 
 
256 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>