More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2246 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  87.5 
 
 
257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  86.77 
 
 
257 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.1 
 
 
250 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  72.36 
 
 
250 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  64.2 
 
 
253 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  55.38 
 
 
261 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 
248 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  55.51 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  56.33 
 
 
250 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  55.1 
 
 
250 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  53.44 
 
 
253 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  53.53 
 
 
268 aa  265  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  53.44 
 
 
265 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  52.21 
 
 
263 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  51.21 
 
 
251 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  48.98 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  47.35 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  45.16 
 
 
254 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  45.97 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  46.72 
 
 
254 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  48.56 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  45.71 
 
 
254 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.93 
 
 
250 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  47.54 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  47.13 
 
 
251 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  46.56 
 
 
264 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.08 
 
 
247 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  44.53 
 
 
249 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  47.92 
 
 
249 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
249 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
249 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  44.4 
 
 
255 aa  205  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.44 
 
 
250 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  44.26 
 
 
249 aa  201  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  48.35 
 
 
255 aa  201  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.38 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  43.43 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  43.32 
 
 
252 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  43.44 
 
 
246 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
266 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  47.54 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  44.94 
 
 
253 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  47.11 
 
 
251 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  42.39 
 
 
258 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  42.51 
 
 
250 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  46.96 
 
 
249 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  41.5 
 
 
256 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  41.91 
 
 
256 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  41.5 
 
 
256 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  41.49 
 
 
256 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  44.49 
 
 
245 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  43.43 
 
 
258 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  41.98 
 
 
258 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  42.74 
 
 
263 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.03 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  41.87 
 
 
250 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  43.03 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  43.43 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  43.43 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  43.43 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  45.85 
 
 
257 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  43.03 
 
 
258 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  42.32 
 
 
256 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  45.78 
 
 
263 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  41.63 
 
 
257 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  42.41 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  43.03 
 
 
251 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
257 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  46.89 
 
 
233 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  43.03 
 
 
258 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  40.96 
 
 
252 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  43.03 
 
 
258 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  39.36 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  45.64 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.63 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  42.17 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.15 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  43.15 
 
 
250 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  42.98 
 
 
251 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  41.7 
 
 
260 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.75 
 
 
264 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
260 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  42.32 
 
 
257 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.4 
 
 
271 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  43.03 
 
 
251 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44.75 
 
 
265 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.64 
 
 
233 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  41.32 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  41.83 
 
 
273 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  44.49 
 
 
852 aa  188  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 
256 aa  188  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>