More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2123 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  58.61 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  55.69 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  56.56 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  54.84 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 256 aa  262  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  56.43 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  53.04 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  56.97 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  59.43 
 
 		 255 aa  254  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  54.88 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  55.65 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  57.72 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  49.38 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  50.2 
 
 		 248 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  52.87 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  47.58 
 
 		 252 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  46.94 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  49.59 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  50.63 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  45.53 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  48.37 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  47.76 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  47.77 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  55.14 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  47.18 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  48.96 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  50.81 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  53.28 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  49.38 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  47.97 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  46.15 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  48.36 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  47.15 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  48.73 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  48.13 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  47.13 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  47.15 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  48.77 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  45.57 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  46.31 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  49.39 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  46.41 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  47.33 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.35 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  47.33 
 
 		 252 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  47.95 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  47.95 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  46.06 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  49.8 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  45.53 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  45.53 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  48.12 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  47.08 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.53 
 
 		 859 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  46.69 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  45.9 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  45.08 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  45.68 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  46.28 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  44.8 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  45.53 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  46.75 
 
 		 594 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  47.06 
 
 		 597 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  46.89 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  41.94 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  41.94 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  45.63 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  44.03 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  46.53 
 
 		 267 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  46.06 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  43.62 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  46.06 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  44.44 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  44.35 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  45.64 
 
 		 266 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  48.95 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  43.93 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  46.12 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  42.8 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  45.67 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  44.44 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  44.86 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  45.61 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  43.8 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>