More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1750 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  79.37 
 
 		 268 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  81.2 
 
 		 265 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  80.4 
 
 		 263 aa  410  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  76.42 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.74 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  60.17 
 
 		 250 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  60.17 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  59.34 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  54.15 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  53.94 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  53.94 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  52.02 
 
 		 250 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.61 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  52.03 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.77 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  46.18 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  47.2 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  47.11 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  45.49 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  45.34 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  46.28 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.03 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.17 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  47.15 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  43.95 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  42.92 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  41.2 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  40.73 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40.78 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  44.81 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.87 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  41.53 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  41.13 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  41.13 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  41.74 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  41.06 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  41.77 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.18 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  42.56 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  41.7 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  40.96 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  41.7 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  40.89 
 
 		 262 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  42.91 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  41.06 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.32 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  40.57 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  40.08 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 		 277 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  40.49 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  42.8 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  43.39 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.08 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.02 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  39.26 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  39.68 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  39.43 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  41.87 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  39.43 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  40.49 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  40.16 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  40.56 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  40.5 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  43.32 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  39.02 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  40.96 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  38.49 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.57 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.7 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  42.63 
 
 		 259 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.18 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.2 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>