More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0735 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  57.03 
 
 
250 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  55.82 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  55.1 
 
 
250 aa  262  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  55.1 
 
 
246 aa  262  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  51.63 
 
 
251 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  54.62 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  54.47 
 
 
251 aa  258  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  51.01 
 
 
250 aa  254  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  53.54 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  52.59 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  54.22 
 
 
251 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  57.89 
 
 
249 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  57.89 
 
 
250 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  52 
 
 
249 aa  248  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 
255 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  46.56 
 
 
257 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  47.98 
 
 
254 aa  242  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  48.8 
 
 
250 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 
248 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  49 
 
 
249 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  51.41 
 
 
250 aa  238  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  55.69 
 
 
250 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  46.27 
 
 
253 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  47.77 
 
 
258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  48 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  51.84 
 
 
251 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  47.81 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  47.54 
 
 
252 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  52.82 
 
 
254 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  44.75 
 
 
257 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  45.9 
 
 
245 aa  224  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  47.98 
 
 
255 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 
255 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  45.53 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.35 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  46.5 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  43.95 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  46.15 
 
 
859 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  47.56 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.56 
 
 
256 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
266 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  44.26 
 
 
254 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  47.39 
 
 
251 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.98 
 
 
256 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.98 
 
 
256 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  43.21 
 
 
254 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
250 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  40.73 
 
 
250 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.13 
 
 
255 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  40.32 
 
 
251 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.49 
 
 
247 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  44.21 
 
 
484 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.39 
 
 
249 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  49.39 
 
 
249 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  43.8 
 
 
597 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.58 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  42.91 
 
 
253 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  40.98 
 
 
253 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  42.86 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.84 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  198  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1133  ABC transporter related  45.49 
 
 
261 aa  198  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.03 
 
 
250 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 
250 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  44.31 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  44 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  39.92 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  43.6 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
251 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  43.32 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  40.93 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 
256 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  42.8 
 
 
594 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.35 
 
 
249 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.26 
 
 
252 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  40.41 
 
 
625 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  41.6 
 
 
250 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.83 
 
 
251 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  44.14 
 
 
278 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  41.77 
 
 
258 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  39.69 
 
 
252 aa  192  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  43.2 
 
 
250 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
254 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  41.35 
 
 
249 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.61 
 
 
261 aa  192  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  43.04 
 
 
253 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  44.17 
 
 
272 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  39.11 
 
 
284 aa  192  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  40.8 
 
 
267 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  40.5 
 
 
258 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  46.5 
 
 
233 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  42.04 
 
 
257 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  39.92 
 
 
255 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  39.92 
 
 
255 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>