More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4001 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  73.28 
 
 
250 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  72.36 
 
 
249 aa  334  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  58 
 
 
250 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  63.52 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  54.22 
 
 
251 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  55.02 
 
 
251 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  53.04 
 
 
250 aa  259  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 
256 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  52.59 
 
 
249 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  50.82 
 
 
246 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  53.25 
 
 
264 aa  244  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  51.2 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  48.59 
 
 
251 aa  239  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  54.92 
 
 
255 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  49.8 
 
 
251 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
248 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  48.18 
 
 
250 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
250 aa  235  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  50 
 
 
250 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  49 
 
 
250 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  48.59 
 
 
254 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  48.77 
 
 
249 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  49.39 
 
 
251 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  47.18 
 
 
250 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  47.04 
 
 
252 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  45.75 
 
 
249 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  50.82 
 
 
251 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  45.53 
 
 
258 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  46.91 
 
 
258 aa  222  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  49.19 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  45.85 
 
 
253 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  45.68 
 
 
245 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  47.11 
 
 
282 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  42.91 
 
 
257 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  45.78 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  45.12 
 
 
249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  46.96 
 
 
859 aa  214  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  44.08 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  45.71 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  46.34 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  45.53 
 
 
252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  45.38 
 
 
267 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  44.94 
 
 
255 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  44.31 
 
 
249 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  47.18 
 
 
251 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  45.08 
 
 
248 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  41.94 
 
 
250 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 
250 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  41.94 
 
 
251 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  42.74 
 
 
258 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 
250 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  44.86 
 
 
250 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  44.75 
 
 
257 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.62 
 
 
250 aa  204  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  45.12 
 
 
250 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  43.8 
 
 
842 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  46.06 
 
 
262 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  46.06 
 
 
266 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  42.51 
 
 
256 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  46.06 
 
 
266 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
266 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  44.86 
 
 
250 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  46.69 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 
248 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 
259 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  44.63 
 
 
250 aa  198  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  43.14 
 
 
253 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  44.35 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  43.09 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.45 
 
 
250 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  44.13 
 
 
251 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.51 
 
 
256 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.32 
 
 
250 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 
249 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
271 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  47.97 
 
 
249 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  41.6 
 
 
263 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
257 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  47.52 
 
 
233 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  41.7 
 
 
256 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  41.04 
 
 
256 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  41.7 
 
 
256 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  41.46 
 
 
257 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
257 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
257 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
257 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
257 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  41.74 
 
 
254 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
257 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  42.21 
 
 
257 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
257 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  42 
 
 
250 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  42 
 
 
250 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  42.39 
 
 
252 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
257 aa  191  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  38.46 
 
 
253 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.27 
 
 
252 aa  191  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>