More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1589 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  93.17 
 
 		 250 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  92.4 
 
 		 250 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  83.87 
 
 		 248 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  61.13 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  59.75 
 
 		 268 aa  299  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  60.73 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  60.24 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  60.17 
 
 		 253 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 250 aa  274  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  55.51 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  55.1 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  53.82 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  52.21 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  49.8 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  51.43 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  47.79 
 
 		 254 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.24 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  45.97 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  46.99 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  46.77 
 
 		 254 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  45.97 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  44.58 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.35 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.74 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  41.94 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.94 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  43.6 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  45.64 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.86 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  42.97 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  45.63 
 
 		 249 aa  197  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  43.55 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  41.22 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  47.7 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  42.21 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.21 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.3 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  41.91 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  43.44 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  40.33 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  43.21 
 
 		 859 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  40.74 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  41.84 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  41.22 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 271 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  39.42 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  46.09 
 
 		 251 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  39.42 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.25 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  43.46 
 
 		 852 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  44.53 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.34 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  41.08 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  39.26 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  43.27 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  39.42 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  39.51 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  39.18 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  43.15 
 
 		 842 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  39.42 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  40.25 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  41.6 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  40.34 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  42.17 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  41.8 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  40.83 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  38.93 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  40.25 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  39 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  39.42 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  43.72 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  38.82 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  38.15 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  41 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  39.92 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  38.27 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  38.78 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  39.83 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  42.57 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40.48 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  40.66 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  39.42 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  36.99 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  39.42 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>