More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0854 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.49 
 
 		 484 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  41.18 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  40.64 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  40.33 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  43.72 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  40.78 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 250 aa  187  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  41.11 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  40.16 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  41.2 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  40.24 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  39.22 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  39.02 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  41.13 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  38.04 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  41.7 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  38.43 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  38.8 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  39.11 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  39.27 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  38.15 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  37.15 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  38.21 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  40.41 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  40.65 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  38.46 
 
 		 254 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  38.43 
 
 		 840 aa  174  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  40.48 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  41.94 
 
 		 505 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  42 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  41.22 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  40.82 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  40.82 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  40.24 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  38.72 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  40.08 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  39.91 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  39.84 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  37.96 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  37.96 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  37.96 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  39.51 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  37.45 
 
 		 840 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  39.04 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  35.37 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  35.95 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  38.21 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  38.87 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  35.89 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  41.53 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  38.62 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  34.27 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  37.25 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 610 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  39.75 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  38.34 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  38.84 
 
 		 852 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  36.8 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  36.33 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  38.98 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  38.52 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.27 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  38.78 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  39.2 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  36.47 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  35.95 
 
 		 840 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  38.66 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  38.93 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  36.59 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  37.25 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  39.2 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  35.2 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  39.6 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  38.11 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  37.86 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2111  ABC transporter related  41.38 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.824296  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  37.94 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  40.82 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  34.71 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  37.5 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  34.71 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.86 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  36.75 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  38.59 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  36.07 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  36.25 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  37.55 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>