More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5447 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  48.77 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  50.82 
 
 		 263 aa  245  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  50.82 
 
 		 265 aa  244  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  52.89 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  48.77 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  52.48 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  49.79 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  51.22 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  51.24 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  49.79 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  51.24 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  50.83 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  48.76 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  50.4 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  51.64 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  47.93 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  44.26 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  45.04 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  45.04 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.31 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  44.81 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  45.04 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  43.85 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.49 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  43.03 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  43.55 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.74 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  42 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  39.92 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  43.37 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  41.15 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  42.62 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  40.33 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  42.45 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  41.95 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  43.15 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  40.24 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  40.74 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0668  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  39.83 
 
 		 272 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  40.57 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  45.56 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  42.11 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  41.8 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  38.21 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  41.08 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  40.57 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  41.6 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  40.66 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.39 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  40.98 
 
 		 484 aa  175  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  41.5 
 
 		 255 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.63 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  44.08 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  41.22 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  37.19 
 
 		 840 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  42.56 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  41.98 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 257 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  40.16 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  40.94 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.83 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  38.91 
 
 		 852 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  42.32 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  40.33 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  42.74 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  39.09 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  41.3 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  38.58 
 
 		 284 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.86 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  38.68 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.94 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  38.46 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  40.94 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>