More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2234 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  70.45 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  59.04 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  53.06 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  51.64 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  48.36 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  47.97 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  48.19 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  49.58 
 
 		 249 aa  232  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  48.16 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  45.75 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  52.65 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.75 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  48.15 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  48.36 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  47.18 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  44.58 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  49.17 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  47.74 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  47.33 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  53.31 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  50.62 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  46.56 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  44.53 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  45.75 
 
 		 250 aa  214  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  45.71 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  45.34 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.53 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  47.54 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  43.72 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.72 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  41.63 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 282 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  41.04 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 		 257 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  41.22 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  44.72 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.97 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  47.33 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.68 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  41.18 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  46.41 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  39.68 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.23 
 
 		 248 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  39 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  39.68 
 
 		 268 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  40.91 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  40 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  39.17 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  41.98 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  40 
 
 		 251 aa  184  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  44.13 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  38.52 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  42.15 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  39.67 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  40.91 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  39.34 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  39.02 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  40.24 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  40.24 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  40.73 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  38.33 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  38.02 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  38.87 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  38.62 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  39.34 
 
 		 859 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  41.22 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  43.04 
 
 		 484 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  38.93 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  37.9 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  38.21 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  41.06 
 
 		 505 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  37.96 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  42.45 
 
 		 842 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  41.32 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  39.18 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  38.93 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  38.52 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  38.93 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  39.36 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  37.6 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  38.11 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  38.65 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  38.52 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.9 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  40.08 
 
 		 597 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  38.96 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  39.59 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  38.33 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>