More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4556 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  92.4 
 
 		 250 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  90.76 
 
 		 250 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  84.27 
 
 		 248 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  60.73 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  61.13 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  58.92 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  59.04 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  60.17 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  54.29 
 
 		 257 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  53.88 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  52.61 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  51.81 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  50.61 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  48.59 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  48.59 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.83 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  47.79 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  47.98 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  45.56 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  46.89 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  46.77 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  44.98 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  43.93 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  43.32 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.86 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.74 
 
 		 249 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  42.57 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.94 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  46.77 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.7 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  44.03 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  41.53 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  44.26 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  44.84 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  45.75 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  41.22 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  42.34 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  42.86 
 
 		 859 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  44.49 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  42.08 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  42.68 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  40.16 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  44.84 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  41.22 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  39.34 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  43.39 
 
 		 842 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  45.68 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.02 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  40.34 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  40.25 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.62 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  40.24 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  38.68 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  43.37 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  39 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.34 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  39.42 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.41 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  41.49 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  38.37 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  41.95 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  41.3 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  38.84 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40.08 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  41.53 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  40.93 
 
 		 840 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  40.93 
 
 		 852 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  42.32 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  40.91 
 
 		 840 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.43 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  39 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  41.43 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  38.62 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  39.09 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  39 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  39.09 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.32 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  39.09 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.8 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.43 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>