More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4398 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 
256 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  55.42 
 
 
250 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  50.61 
 
 
251 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  50.41 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  50.4 
 
 
246 aa  228  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  49.39 
 
 
251 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
248 aa  228  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  51.23 
 
 
249 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  55.02 
 
 
255 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  47.18 
 
 
251 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  49.39 
 
 
250 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  51.42 
 
 
249 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  48.57 
 
 
251 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  49 
 
 
250 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  49.17 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  48.39 
 
 
249 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  48.79 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  45.56 
 
 
252 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  51.42 
 
 
254 aa  208  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  45.56 
 
 
254 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  44.67 
 
 
250 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  44.9 
 
 
250 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  48.77 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  41.53 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  44.94 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 
255 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  48.98 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  42.4 
 
 
253 aa  198  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  42.11 
 
 
258 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.4 
 
 
252 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  43.55 
 
 
255 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  45.71 
 
 
248 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  42.91 
 
 
251 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  44.05 
 
 
257 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  42.74 
 
 
254 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  43.39 
 
 
253 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.08 
 
 
252 aa  191  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
249 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  44.81 
 
 
251 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  41.94 
 
 
254 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  44.49 
 
 
250 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
266 aa  188  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  42.97 
 
 
265 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  42.57 
 
 
263 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 
257 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.68 
 
 
250 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
250 aa  184  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  38.52 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  42.28 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  41.74 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  42.97 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.15 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  43.27 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  41.49 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  40.89 
 
 
268 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  41.22 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  39.27 
 
 
249 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  40.41 
 
 
250 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  40.82 
 
 
257 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.22 
 
 
250 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  40.32 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  43.15 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  38.87 
 
 
249 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
271 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  40.5 
 
 
256 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  38.06 
 
 
249 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  40 
 
 
254 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  40.5 
 
 
256 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  38.37 
 
 
254 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  39.84 
 
 
253 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.06 
 
 
244 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  39.92 
 
 
840 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  40.5 
 
 
268 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  39.83 
 
 
258 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  42.04 
 
 
250 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
260 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  39.13 
 
 
255 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  39.59 
 
 
254 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  42.97 
 
 
260 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  41.7 
 
 
246 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  43.03 
 
 
233 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  43.85 
 
 
233 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  42.32 
 
 
250 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  40.32 
 
 
256 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.85 
 
 
233 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  40.65 
 
 
252 aa  175  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  38.78 
 
 
625 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  38.11 
 
 
251 aa  174  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  39.18 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  40.98 
 
 
840 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  39.18 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.2 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  39.08 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  38.27 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  38.27 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>