More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3381 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  534  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  90.8 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  84.8 
 
 		 268 aa  434  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  81.2 
 
 		 253 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  78.21 
 
 		 261 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.57 
 
 		 248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  60.73 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  61.13 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  59.92 
 
 		 250 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  52.38 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  51.15 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  51.15 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  52.7 
 
 		 251 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.8 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  51.81 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.82 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  49.2 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  44.58 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  46.15 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  46.64 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  45.2 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  45.87 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.44 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  43.92 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.92 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  43.36 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  41.34 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  45.9 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  42.92 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.2 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  40.16 
 
 		 258 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  40.89 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  44.53 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  39.43 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  41.3 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  38.93 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  40.98 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  39.11 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.53 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  40.24 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  39.31 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  38.8 
 
 		 253 aa  188  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  43.55 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  40.24 
 
 		 249 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  40.91 
 
 		 249 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  38.93 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  40.91 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  38.71 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  41.11 
 
 		 254 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.53 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  40.65 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  40.39 
 
 		 840 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  42.97 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  38.71 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  38.43 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  40.08 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.75 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  45.75 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  38.31 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.6 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  40.82 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5665  ABC transporter related  42.86 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  40.57 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  40 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  38.55 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  39.26 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  39.6 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  41.2 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  40.85 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  39.76 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  42.51 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  40.74 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.18 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  41.7 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>