More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0084 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  77.64 
 
 		 252 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  68.31 
 
 		 245 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  69.83 
 
 		 282 aa  318  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  67.35 
 
 		 258 aa  317  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  65.98 
 
 		 255 aa  315  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  64.08 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  56.5 
 
 		 251 aa  271  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  56.97 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  55.2 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  56.56 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  56.73 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  56.33 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  55.34 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  52.65 
 
 		 257 aa  255  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  53.11 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  52.87 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  50.2 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  52.63 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  48.36 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  46.96 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  47.98 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  49.17 
 
 		 597 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  49.17 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  49.39 
 
 		 249 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  49.38 
 
 		 594 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  48.15 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  49.39 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  50.41 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  53.63 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  47.33 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.08 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  51.23 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  47.56 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  46.77 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  48.4 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  46.31 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  49.18 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  46.37 
 
 		 249 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.12 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.53 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  46.72 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.86 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  45.71 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  45.12 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.86 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  42.51 
 
 		 859 aa  204  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  45.71 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  45.31 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  45.38 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.85 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  44.67 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  43.27 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  45.31 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  45.38 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  48.18 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  42.97 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  44.98 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  45.75 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  42.97 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  43.98 
 
 		 484 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  43.44 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  42.68 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  43.44 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  44 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  44.58 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  43.85 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.16 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  44.67 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  45.68 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  42.51 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  43.5 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  41.37 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.62 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  43.7 
 
 		 272 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.72 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  44.72 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  46.12 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  40.16 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  40.5 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  39.75 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  39.26 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.56 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  42.63 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>