More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1362 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  54.25 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  53.41 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.37 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  52.03 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  52.7 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  52.65 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  52.48 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  51.21 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  51.21 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  50.61 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  50 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  51.43 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  51.01 
 
 		 257 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  50.61 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  50.61 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  50.21 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  47.93 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  48.16 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  52.07 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.4 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  47.52 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  48.37 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  46.56 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.9 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  46.96 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  46.12 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.55 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  46.15 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  47.54 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  46.69 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  41.94 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.13 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  47.79 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  45.27 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  43.62 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.53 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  43.51 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  43.72 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  43.16 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  44.81 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  42.56 
 
 		 840 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  47.76 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.51 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  42.68 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  43.72 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  40.25 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  43.32 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  42.45 
 
 		 852 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  44.9 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  46.28 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  44.18 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  41.22 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  46.91 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  41.67 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  45.23 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  41.9 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  45.23 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  41.7 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  42.23 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  40.41 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  41.63 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3724  ABC transporter component  45.45 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3320  ABC transporter related  45.93 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  40 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  41.46 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  44.63 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  42.04 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  41.77 
 
 		 840 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  42.91 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  39.75 
 
 		 863 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  41.6 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  40.71 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  40.71 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  44.67 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  45.6 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  40.74 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  40.66 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  39.59 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  39.18 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 271 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  40.74 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  40.56 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  38.43 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  41.49 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>