More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1582 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  93.17 
 
 		 250 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  90.76 
 
 		 250 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  85.48 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  59.92 
 
 		 265 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  59.92 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  58.92 
 
 		 268 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  59.2 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  59.34 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.82 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  54.88 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  54.47 
 
 		 257 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 257 aa  267  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  53.41 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  51.23 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  52.65 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  49.6 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  46.4 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.24 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  47.6 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  47.2 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  46.8 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  46.4 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  44.98 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  46.75 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.12 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  42.98 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.23 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  44.4 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.96 
 
 		 859 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.43 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  40.73 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  44.4 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.3 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  41.94 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  45.24 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.21 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  43.15 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  43.85 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  40.96 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  41.49 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  47.28 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  39.59 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  41.1 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  40.66 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  46.09 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  42.32 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  44.53 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  40.82 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.34 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  40.25 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  41.67 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  43.8 
 
 		 842 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  39.92 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  38.8 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  39.18 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  40.34 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  42.5 
 
 		 852 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  39.09 
 
 		 258 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  39.83 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  41.6 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  44 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  39.09 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  41.06 
 
 		 840 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  40.76 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  38.78 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  39.42 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  40.34 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  39.42 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  41.8 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  40.89 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  40.5 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  42.32 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  38.17 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  37.76 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  40.25 
 
 		 840 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  40.25 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  41.6 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  37.76 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  38.27 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  40.98 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  38.78 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  38.52 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.32 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  42.04 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  39.59 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  39.42 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  40.73 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>