More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4485 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  523  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  56.97 
 
 		 250 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  59.04 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  61.41 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  57.72 
 
 		 251 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  56.9 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  56.43 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  59.02 
 
 		 255 aa  254  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  59.43 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.54 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  58.13 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  56.85 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  53.88 
 
 		 248 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  53.25 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  50.8 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  50.81 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  49.6 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  52.02 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  54.07 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  52.02 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  51.82 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  47.33 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  50.8 
 
 		 250 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  47.33 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  45.75 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  50.4 
 
 		 250 aa  215  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  46.77 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  47.24 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  46.18 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  46.77 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  45.78 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  48.58 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  48.24 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  45.6 
 
 		 249 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  46.96 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  45.34 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  49.01 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  46.25 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  47.37 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  46.37 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  48.98 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  46.67 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  47.62 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  44 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  45.71 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  46.99 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  47.35 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  46.74 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44.94 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44.94 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  45.68 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.75 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  47.01 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  45.95 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  47.54 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  42.56 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  43.55 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  43.15 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  42.74 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  43.37 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.12 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.9 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  39.75 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  47.52 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  41.39 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  43.15 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.85 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  45.02 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.39 
 
 		 255 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  41.74 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  43.36 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  46 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  43.92 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  43.85 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  42.34 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  46.5 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  42.69 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  40.16 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  45.6 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.5 
 
 		 233 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  43.44 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  44.4 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.63 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>